1995年，厦门市有8家公证处。2000年以后，根据司法部《关于深化公证工作改革方案》的要求，公证处相继转制为事业体制，2000年6月，厦门市第一家合作制公证处——鹭江公证处成立。行政区划调整后，现全市共有7家公证处，其中事业单位编制公证处6家，合作制公证处1家。

从1996年起，在市人大通过的地方法规中，有3部法规分别规定了房屋买卖、房屋折迁和工程投标必须经过公证。这些规定起到规范公证业务，强化公证职能，发挥公证服务、沟通、监督、引导的作用，保障了公证处依法履行职责，促进了全市公证业务的发展。

厦门各公证处在改革机制、拓展业务的同时，积极开展创建文明公证处、争当文明公证员活动。市公证处1995年被省司法厅评为“省级文明窗口示范单位”；1998年及2002年，被评为省级文明公证处；2003年8月被福建省委、省政府授予2000-2002年度创建文明行业先进单位；2004年被司法部、中国公证员协会授予全国公证行业文明公证处。全市先后有5名公证员被评为省级文明公证员或“十佳公证员”。公证员苏国强于1997年6月被司法部评为“全国优秀公证员”，并先后被选为福建省公证员协会副会长、中国公证员协会副会长。